分支機構企業(yè)所得稅申報問題，尤其是分攤繳納的計算方法和能否參與就地分攤的問題，一直是企業(yè)比較關注的。小編結合實際案例，為您詳細分析分支機構如何計算、繳納企業(yè)所得稅。

總機構A公司注冊于南京市，主要從事電子產(chǎn)品的生產(chǎn)、銷售，設立具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能的部門，且該部門的營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額與管理職能部門分開核算。A公司于2017年在深圳設立有分支機構B分公司，于2018年在杭州設立有分支機構C分公司，分別適用25%的企業(yè)所得稅稅率。

假設2018年度，A公司各個季度匯總計算的實際利潤額均為300萬元，2018年度企業(yè)所得稅匯算清繳時，A公司匯總計算的應納稅所得額為1000萬元。

2017年度，各分支機構的營業(yè)收入、職工薪酬、資產(chǎn)總額分別為：A公司主體生產(chǎn)經(jīng)營部門2500萬元、40萬元、1500萬元；B分公司1000萬元、30萬元、1500萬元，合計為3500萬元、70萬元、3000萬元。

分支機構可以分四步計算、繳納企業(yè)所得稅。

一、分清需就地分攤繳納企業(yè)所得稅的分支機構

根據(jù)《國家稅務總局關于印發(fā)〈跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法〉的公告》(國家稅務總局公告2012年第57號，以下簡稱57號公告)第四條規(guī)定，總機構和具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能的二級分支機構，就地分攤繳納企業(yè)所得稅。其中，二級分支機構，是指匯總納稅企業(yè)依法設立并領取非法人營業(yè)執(zhí)照(登記證書)，且總機構對其財務、業(yè)務、人員等直接進行統(tǒng)一核算和管理的分支機構。

同時，57號公告第十六條規(guī)定，總機構設立具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能的部門，且該部門的營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額與管理職能部門分開核算的，可將該部門視同一個二級分支機構。也就是說，可以分攤繳納企業(yè)所得稅的二級分支機構有三個：A公司的主體生產(chǎn)經(jīng)營部門、B分公司和C分公司。

值得注意的是，有五類二級分支機構，不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。其中包括：不具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能，且在當?shù)夭焕U納增值稅、營業(yè)稅的產(chǎn)品售后服務、內(nèi)部研發(fā)、倉儲等匯總納稅企業(yè)內(nèi)部輔助性的二級分支機構;上年度認定為小型微利企業(yè)的;當年新設立的二級分支機構;當年撤銷的二級分支機構;匯總納稅企業(yè)在中國境外設立的不具有法人資格的二級分支機構。由于C分公司為當年新設立分支機構，所以，2018年只有A公司的主體生產(chǎn)經(jīng)營部門和B分公司，需要就地分攤繳納企業(yè)所得稅。

二、各分支機構計算需分攤的比例

根據(jù)57號公告第十五條規(guī)定，總機構應按照上年度分支機構的營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額三個因素計算各分支機構分攤所得稅款的比例，三因素的權重依次為0.35、0.35、0.30。

具體計算公式為：某分支機構分攤比例=(該分支機構營業(yè)收入÷各分支機構營業(yè)收入之和)×0.35+(該分支機構職工薪酬÷各分支機構職工薪酬之和)×0.35+(該分支機構資產(chǎn)總額÷各分支機構資產(chǎn)總額之和)×0.30。

也就是說，2018年度A公司主體生產(chǎn)經(jīng)營部門分攤比例=2500÷3500×0.35+40÷70×0.35+1500÷3000×0.30=60%；

B分公司分攤比例=1000÷3500×0.35+30÷70×0.35+1500÷3000×0.30=40%。

三、各分支機構按季度預繳納稅

57號公告第六條規(guī)定，匯總納稅企業(yè)按照《企業(yè)所得稅法》規(guī)定匯總計算的企業(yè)所得稅，包括預繳稅款和匯算清繳應繳應退稅款，50%在各分支機構間分攤，各分支機構根據(jù)分攤稅款就地辦理繳庫或退庫；50%由總機構分攤繳納。

也就是說，A公司2018年各季度匯總計算的應納所得稅額=300×25%=75(萬元)，各季度應分攤的所得稅額=75×50%=37.50(萬元)。同時，A公司的各分支機構各季度需分攤的所得稅額=75×50%=37.50(萬元)，按照第一步計算的各分支機構應分攤比例，A公司主體生產(chǎn)經(jīng)營部門各季度分攤的所得稅額=37.50×60%=22.50(萬元)，B分公司各季度需分攤的所得稅額=37.50×40%=15(萬元)。

整體上來看，A公司總分機構2018年累計預繳的應納所得稅額=75×4=300(萬元)。

四、分支機構根據(jù)總機構年度匯算清繳情況，分攤應繳或應退稅額。

根據(jù)57號公告第十條規(guī)定，匯總納稅企業(yè)應當自年度終了之日起五個月內(nèi)，由總機構匯總計算企業(yè)年度應納所得稅額，扣除總機構和各分支機構已預繳的稅款，計算出應繳應退稅款，按照本辦法規(guī)定的稅款分攤方法計算總機構和分支機構的企業(yè)所得稅應繳應退稅款，分別由總機構和分支機構就地辦理稅款繳庫或退庫。也就是說，在哪里入庫就從哪里退稅。

2018年度，A公司應納所得稅額=1000×25%=250(萬元)，小于A公司總分機構本年累計預繳的300萬元。那么，A公司本年應退的所得稅額=300-250=50(萬元)。A公司所屬分支機構分攤本年應退的總所得稅額=50×50%=25(萬元)，其中，A公司主體生產(chǎn)經(jīng)營部門應退的所得稅額=25×60%=15(萬元)，B分公司應退的所得稅額=25×40%=10(萬元)。

A公司在完成企業(yè)所得稅年度納稅申報時，應填報《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)年度分攤企業(yè)所得稅明細表》和《企業(yè)所得稅匯總納稅分支機構所得稅分配表》，B分公司需據(jù)上表完成當年的企業(yè)所得稅年度納稅申報。

《企業(yè)所得稅法》第五十條規(guī)定，居民企業(yè)在中國境內(nèi)設立不具有法人資格營業(yè)機構的，應當匯總計算并繳納企業(yè)所得稅。也就是說，如無特殊規(guī)定，分支機構應當匯總申報企業(yè)所得稅，屬于法理規(guī)定，不具備選擇性。

設立有分支機構的企業(yè)，應加強對57號公告的學習理解，按規(guī)定梳理出需就地分攤繳納企業(yè)所得稅的分支機構，由總機構在主管稅務機關將需匯總分支機構做匯總納稅信息備案后，分支機構再憑備案表到主管稅務機關做企業(yè)所得稅信息維護。

值得注意的是，57號公告主要闡述跨地區(qū)(跨地區(qū)，指的是總分機構不在同一省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市)總分機構的計算繳納申報規(guī)定。

小編提醒，未跨地區(qū)設立分支機構的企業(yè)，還需關注所在地區(qū)稅務部門制定的具體辦法。

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