（一）進項稅額
1.用于抵扣進項稅額的增值稅專用發(fā)票是否真實合法：是否有開票單位與收款單位不一致或票面所記載貨物與實際入庫貨物不一致的發(fā)票用于抵扣。
2.用于抵扣進項的運費發(fā)票是否真實合法；是否有與購進和銷售貨物無關(guān)的運費申報抵扣進項稅額；是否有以購進固定資產(chǎn)發(fā)生的運費或銷售免納增值稅的固定資產(chǎn)發(fā)生的運費抵扣進項稅額；是否有以國際貨物運輸代為辦理業(yè)發(fā)票和國際貨物運輸發(fā)票抵扣進項；是否存在以開票方與承運方不一致的運輸發(fā)票抵扣進項；是否存在以項目填寫不齊全的運輸發(fā)票抵扣進項稅額等情況。
3.是否存在未按規(guī)定開具農(nóng)產(chǎn)品收購統(tǒng)一發(fā)票申報抵扣進項稅額的情況，具體包括：向經(jīng)銷農(nóng)產(chǎn)品的單位和個人收購農(nóng)產(chǎn)品開具農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票；擴大農(nóng)產(chǎn)品范圍，把非免稅農(nóng)產(chǎn)品（如方木、枕木、道木、鋸材等）開具成免稅農(nóng)產(chǎn)品（如原木）；虛開農(nóng)產(chǎn)品收購統(tǒng)一發(fā)票（虛開數(shù)量、單價、抵扣稅款）。
4.用于抵扣進項稅額的廢舊物資發(fā)票是否真實合法。
5.用于抵扣進項稅額的廢舊物資發(fā)票是否真實合法。
6.是否存在購進固定資產(chǎn)申報抵扣進項稅額的情況。
7.是否存在購進材料、電、汽等貨物用于在建工程、集體福利等非應稅項目等未按規(guī)定轉(zhuǎn)出進項稅額的情況。
8.發(fā)生退貨或取得折讓是否按規(guī)定作進項稅額轉(zhuǎn)出。
9.用于非應稅項目和免稅項目、非正常損失的貨物是否按規(guī)定作進項稅額轉(zhuǎn)出。
10.是否存在凈返利掛入其他應付款、其他應收款等往來賬或沖減營業(yè)費用，而不作進項稅額轉(zhuǎn)出的情況。
（二）銷項稅額
1.銷售收入是否完整及時入賬：是否存在以貨易貨交易未記收入的情況：是否存在以貨抵債收入的情況：是否存在銷售產(chǎn)品不開發(fā)票，取得的收入不按規(guī)定入賬的情況；是否存在銷售收入長期掛賬不轉(zhuǎn)收入的情況；是否存在將收取的銷售款項，先支付費用（如購貨方的回扣、推銷獎、營業(yè)費用、委托代銷商品的手續(xù)費等），再將余款入賬作收入的情況。
2.是否存在視同銷售行為，未按規(guī)定計提銷項稅額的情況：將自產(chǎn)或委托加工的貨物用于非應稅項目、集體福利或個人消費，如用于內(nèi)設的食堂、賓館、醫(yī)院、托兒所、學校、俱樂部、家屬社區(qū)等部門，不計或少計應稅收入；將自產(chǎn)、委托加工或購買的貨物用于投資、分配、無償捐助等、不計或少計應稅收入。
3.是否存在開具不符合規(guī)定的紅字發(fā)票沖減應稅收入的情況；發(fā)生銷貨退回，銷售折扣或折讓，開具的紅字發(fā)票和賬務處理是否符合稅法規(guī)定。
4.是否存在購進的材料、水、電、汽等貨物用于對外銷售、投資、分配及無償贈送，不計或少計應稅收入的情況：收取外單位或個人水、電、汽等費用，不計、少計收入或沖減費用；將外購的材料改變用途，對外銷售、投資、分配及無償贈送等未按視同銷售的規(guī)定計稅。
5.向購貨方收取的各種價外費用（例如手續(xù)費、補貼、集資費、返還利潤、獎勵費、違約金、運輸裝卸費等等）是否按規(guī)定納稅。
6.設有兩個以上的機構(gòu)并實行統(tǒng)一核算的納稅人，將貨物從一個機構(gòu)移送到其他機構(gòu)（不在同一縣市）用于銷售，是否作銷售處理。
7.對逾期未收回的包裝物押金是否按規(guī)定計提銷項稅額。
8.是否有應繳納增值稅項目的業(yè)務按工營業(yè)稅繳納。
9.增值稅混合銷售行為是否依法納稅：對增值稅稅法規(guī)定應視同銷售征稅的行為是否按規(guī)定納稅；從事貨物運輸業(yè)務的單位和個人，發(fā)生銷售貨物并負責運輸所售貨物的混合銷售行為，是否按規(guī)定繳納增值稅。
10.兼營的非應稅勞務的納稅人，是否按規(guī)定分別核算貨物或應稅勞務和非應稅勞務的銷售額；對不分別核算或者不能準確核算的，是否按增值稅的規(guī)定一并繳納增值稅。
11.按照增值稅稅法規(guī)定應征收增值稅的代購貨物、代為辦理進口貨物的行為，是否繳納了增值稅。
12.免稅貨物是否依法核算：增值稅納稅人免征增值稅的貨物或應稅勞務，是否符合稅法的有關(guān)規(guī)定；有無擅自擴大免稅范圍的問題；軍隊、軍工系統(tǒng)的增值稅納稅人，其免稅的企業(yè)、貨物和勞務范圍是事符合稅法的規(guī)定；福利、校辦企業(yè)其免稅的企業(yè)、貨物和勞務范圍是否符合稅法的規(guī)定；兼營免稅項目的增值稅一般納稅人，其免稅額、不予抵扣的進項稅額計算是否準確？