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年終獎個人所得稅的計算方法如下：
1. 先計算應納稅所得額，即年終獎金額減去個人所得稅起征點（目前為5000元），得到應納稅所得額。
2. 根據應納稅所得額查找適用稅率和速算扣除數，計算出應繳納的個人所得稅。
3. 最終所得稅金額為應繳納的個人所得稅減去已繳納的稅款（如有），即為實際需要繳納的個人所得稅金額。

例如，某員工的年終獎為10萬元，個人所得稅起征點為5000元，適用稅率為25%，速算扣除數為18750元。則該員工應繳納的個人所得稅為：

應納稅所得額 = 10萬元 - 5000元 = 95萬元

應繳納的個人所得稅 = 95萬元 × 25% - 18750元 = 19562.5元

如果該員工已經在工資中繳納了5000元的個人所得稅，則最終需要繳納的個人所得稅為：

最終所得稅金額 = 19562.5元 - 5000元 = 14562.5元