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根據(jù)《中華人民共和國增值稅法》和《中華人民共和國車輛購置稅法》，運輸企業(yè)購買車輛時支付的車輛購置稅不屬于增值稅的計稅依據(jù)，因此不能作為進項稅額抵扣。

根據(jù)增值稅法，進項稅額抵扣必須符合以下條件：
1. 商品或服務必須與納稅人的應稅銷售活動有關(guān)；
2. 納稅人必須持有增值稅專用發(fā)票或者其他符合國家規(guī)定的發(fā)票；
3. 納稅人必須按照法定程序辦理稅款繳納手續(xù)。

車輛購置稅是一種特殊的稅費，不屬于增值稅的計稅依據(jù)，因此無法作為進項稅額抵扣。但是，購買車輛后，如果用于運輸企業(yè)的生產(chǎn)經(jīng)營活動，可以將購買車輛的成本納入企業(yè)的固定資產(chǎn)，按照相關(guān)規(guī)定進行折舊計提，從而在企業(yè)所得稅方面享受相應的稅務優(yōu)惠。