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有限責(zé)任公司（自然人獨資）應(yīng)該繳納企業(yè)所得稅。企業(yè)所得稅是指企業(yè)、個體工商戶、其他經(jīng)濟組織在營利活動中產(chǎn)生的稅收，是有組織的企業(yè)或經(jīng)濟組織從營利活動中所獲取的利潤、產(chǎn)品、銷售、分配或其他經(jīng)濟活動產(chǎn)生的收入，根據(jù)企業(yè)組織收入的不同，稅率也有所不同。 有限責(zé)任公司（自然人獨資）要繳納企業(yè)所得稅，所得稅的稅率應(yīng)當按照國家的規(guī)定來辦理，一般來說，有限責(zé)任公司（自然人獨資）應(yīng)當按照25%的稅率來繳納企業(yè)所得稅。具體的稅率也可以根據(jù)企業(yè)的實際情況和當?shù)囟悇?wù)部門的要求來辦理，而且具體的稅率也可能會因國家不斷調(diào)整而有所變化。 企業(yè)所得稅不僅要按照稅率來繳納，而且還要做好報稅、申報以及合理避稅的工作，如果因為不注意避稅而有所違法，就有可能會被嚴厲處罰，因此，有限責(zé)任公司（自然人獨資）需要做好合理的避稅工作，避免非法所得稅的產(chǎn)生。 拓展知識：企業(yè)所得稅的稅率一般分為四檔，分別是15%、20%、25%和30%，其中，15%的稅率是小規(guī)模納稅人的稅率，20%和25%的稅率是一般納稅人的稅率，而30%的稅率是高收入企業(yè)的稅率。企業(yè)所得稅雖然稅率比較高，但是在企業(yè)發(fā)展的過程中，仍然有很多優(yōu)惠政策可以享受，例如投資改造過程中可以優(yōu)先扣除一定比例的稅額，經(jīng)國家批準的新產(chǎn)品研發(fā)項目也可以享受稅收優(yōu)惠等等。