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企業(yè)購買廠房自用的印花稅稅率并不是萬分之五。根據(jù)《中華人民共和國印花稅法》和《中國民政部關于印花稅范圍和稅率的規(guī)定》，企業(yè)購買廠房自用的印花稅稅率可以由各地政府實行管理，大部分地區(qū)的稅率范圍在0.05%-0.2%，但也有少數(shù)地區(qū)的稅率較高，比如廣州的印花稅稅率為1.2%。 此外，購買廠房自用的印花稅稅率與購買稅務登記系統(tǒng)注冊號關系密切，由于不同企業(yè)行業(yè)類別和業(yè)務類型不同，一般企業(yè)注冊號減免限額也不同，只有根據(jù)稅務登記系統(tǒng)注冊號及其他相關因素查詢減免比例，才可以得出最終的印花稅稅率。例如，只有查詢稅務登記系統(tǒng)注冊號減免額才可以確定企業(yè)購買廠房自用的印花稅稅率。