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是的，總分公司可以享受季度收入小于45萬免交增值稅的政策。根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實施條例》第五十六條的規(guī)定，企業(yè)進行一般納稅人稅收調整的，季度收入在45萬元以下的企業(yè)，其增值稅發(fā)生出口勞務經營收入的，可以采用季度累計的方式免征增值稅。由于總分公司的季度收入是40萬元和30萬元，所以都可以享受季度收入小于45萬元免交增值稅的政策。當然，具體情況還需要根據(jù)當?shù)囟悇諜C關的規(guī)定和要求進行實施。