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如果該自然人獨資的小規(guī)模納稅人在9月剛注冊，并且還沒有開始經營，那么可以在自然人扣繳客戶端進行零申報。 一般來說，新注冊的企業(yè)在開業(yè)初期，由于沒有實際發(fā)生應稅行為，可以在稅務機關申請辦理零申報手續(xù)。具體來說，如果該企業(yè)在開業(yè)3個月內沒有實際發(fā)生應稅事項，可以在自然人扣繳客戶端進行零申報。 對于小規(guī)模納稅人，如果屬于季節(jié)性加工企業(yè)或其他類似的情況，在淡季沒有實際經營業(yè)務時，也可以在自然人扣繳客戶端進行零申報。 總之，對于新注冊的企業(yè)或個體工商戶，如果沒有實際經營業(yè)務，可以在稅務機關或自然人扣繳客戶端進行零申報。但是需要注意的是，如果企業(yè)已經開始經營并發(fā)生了應稅行為，就必須按照規(guī)定及時申報納稅。