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這種情況下能否適用特殊性稅務重組，需要根據(jù)具體情況進行分析。 特殊性稅務重組是指在符合一定條件的情況下，企業(yè)重組可以享受一些稅收優(yōu)惠政策。然而，適用特殊性稅務重組需要滿足一系列的條件和規(guī)定。 根據(jù)你提供的信息，市本級二級國有企業(yè)按照國資委要求進行業(yè)務和房產的無償劃撥，以及后續(xù)的股權轉讓，雖然市本級二級國有企業(yè)和區(qū)本級國有企業(yè)的股東均為同一個國有企業(yè)，但這并不一定能直接確定是否適用特殊性稅務重組。 在企業(yè)國有產權無償劃轉方面，通常需要遵循相關的管理辦法。例如，《企業(yè)國有產權無償劃轉管理暫行辦法》對國有產權在政府機構、事業(yè)單位、國有獨資企業(yè)、國有獨資公司等之間的無償轉移做出了規(guī)定。 要確定是否適用特殊性稅務重組，可能需要進一步考慮以下因素： 1.重組行為是否符合國家有關法律法規(guī)和產業(yè)政策的規(guī)定； 2.是否有利于優(yōu)化產業(yè)結構和提高企業(yè)核心競爭力； 3.劃轉雙方的產權關系、決策程序等是否符合規(guī)定； 4.相關的財務審計、清產核資等工作是否按要求進行； 5.是否存在不得實施無償劃轉的情形，如被劃轉企業(yè)主業(yè)不符合劃入方主業(yè)及發(fā)展規(guī)劃、中介機構審計報告存在問題、職工分流安置事項未經通過、被劃轉企業(yè)或有負債未有妥善解決方案、劃出方債務未有妥善處置方案等。