有些公司是總分機(jī)構(gòu)的形式，分公司獨(dú)立核算（收入、成本、利潤），領(lǐng)取了非法人營業(yè)執(zhí)照，進(jìn)行了納稅登記。這種形式下的企業(yè)所得稅應(yīng)該如何匯算清繳呢？是季度分別預(yù)交，然后年度由總公司匯算清繳？還是分別進(jìn)行匯算清繳？

總、分機(jī)構(gòu)企業(yè)所得稅實(shí)行按月或按季申報(bào)，就地預(yù)繳。

總機(jī)構(gòu)應(yīng)將統(tǒng)一計(jì)算的企業(yè)當(dāng)期應(yīng)納企業(yè)所得稅額，按核定的分配比例，計(jì)算總機(jī)構(gòu)和各分支機(jī)構(gòu)當(dāng)期應(yīng)納稅額，由總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)分別向所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理納稅申報(bào)。

各分支機(jī)構(gòu)不進(jìn)行企業(yè)所得稅匯算清繳，統(tǒng)一由總機(jī)構(gòu)按照相關(guān)規(guī)定進(jìn)行。

總機(jī)構(gòu)根據(jù)匯總計(jì)算的企業(yè)年度全部應(yīng)納稅額，按規(guī)定的分?jǐn)偙壤?，?jì)算總機(jī)構(gòu)和各分支機(jī)構(gòu)的應(yīng)納企業(yè)所得稅額，扣除各自已預(yù)繳的稅款，分別由總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)多退少補(bǔ)。

分析：

依據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第五十九條第二款規(guī)定，居民企業(yè)在中國境內(nèi)設(shè)立不具有法人資格的營業(yè)機(jī)構(gòu)的，應(yīng)當(dāng)匯總計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅。如果是設(shè)立的分公司，分公司不具有法人地位，而依據(jù)新的企業(yè)所得稅法規(guī)定，企業(yè)所得稅實(shí)行法人所得稅制，所以需要按規(guī)定匯總計(jì)算并按規(guī)定繳納企業(yè)所得稅。

根據(jù)《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》的規(guī)定：

一、居民企業(yè)在中國境內(nèi)跨地區(qū)（指跨省、自治區(qū)、直轄市和計(jì)劃單列市，下同）設(shè)立不具有法人資格分支機(jī)構(gòu)的，該居民企業(yè)為跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)（以下簡稱匯總納稅企業(yè)），除另有規(guī)定外，其企業(yè)所得稅征收管理適用本辦法。

二、匯總納稅企業(yè)實(shí)行“統(tǒng)一計(jì)算、分級管理、就地預(yù)繳、匯總清算、財(cái)政調(diào)庫”的企業(yè)所得稅征收管理辦法：

（一）統(tǒng)一計(jì)算，是指總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算包括匯總納稅企業(yè)所屬各個不具有法人資格分支機(jī)構(gòu)在內(nèi)的全部應(yīng)納稅所得額、應(yīng)納稅額。

（二）分級管理，是指總機(jī)構(gòu)、分支機(jī)構(gòu)所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)都有對當(dāng)?shù)貦C(jī)構(gòu)進(jìn)行企業(yè)所得稅管理的責(zé)任，總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)應(yīng)分別接受機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)的管理。

（三）就地預(yù)繳，是指總機(jī)構(gòu)、分支機(jī)構(gòu)應(yīng)按本辦法的規(guī)定，分月或分季分別向所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)預(yù)繳企業(yè)所得稅。

（四）匯總清算，是指在年度終了后，總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算匯總納稅企業(yè)的年度應(yīng)納稅所得額、應(yīng)納所得稅額，抵減總機(jī)構(gòu)、分支機(jī)構(gòu)當(dāng)年已就地分期預(yù)繳的企業(yè)所得稅款后，多退少補(bǔ)。

三、總機(jī)構(gòu)和具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能的二級分支機(jī)構(gòu)，就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。二級分支機(jī)構(gòu)，是指匯總納稅企業(yè)依法設(shè)立并領(lǐng)取非法人營業(yè)執(zhí)照（登記證書），且總機(jī)構(gòu)對其財(cái)務(wù)、業(yè)務(wù)、人員等直接進(jìn)行統(tǒng)一核算和管理的分支機(jī)構(gòu)。

三、以下二級分支機(jī)構(gòu)不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅：

（一）不具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能，且在當(dāng)?shù)夭焕U納增值稅、營業(yè)稅的產(chǎn)品售后服務(wù)、內(nèi)部研發(fā)、倉儲等匯總納稅企業(yè)內(nèi)部輔助性的二級分支機(jī)構(gòu)，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

（二）上年度認(rèn)定為小型微利企業(yè)的，其二級分支機(jī)構(gòu)不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

（三）新設(shè)立的二級分支機(jī)構(gòu)，設(shè)立當(dāng)年不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

（四）當(dāng)年撤銷的二級分支機(jī)構(gòu)，自辦理注銷稅務(wù)登記之日所屬企業(yè)所得稅預(yù)繳期間起，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

（五）匯總納稅企業(yè)在中國境外設(shè)立的不具有法人資格的二級分支機(jī)構(gòu)，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

根據(jù)對以上內(nèi)容的了解，相信大家對于總分機(jī)構(gòu)的企業(yè)所得稅的管理應(yīng)該有個清晰的認(rèn)識了。

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