根據(jù)國家審計署提交2004年度中央財政預(yù)算執(zhí)行情況和各個專項審計結(jié)果報告來看，38個中央部門存在虛報多領(lǐng)預(yù)算資金、轉(zhuǎn)移挪用或擠占財政資金、私設(shè)賬外賬和“小金庫”以及部分資金使用效益不高等問題。這次審計查出各類違規(guī)金額90.6億元，占審計資金總額的6%.其中，12個部門虛報多領(lǐng)預(yù)算資金4.91億元；26個部門違規(guī)轉(zhuǎn)移挪用財政性資金10.7 5億元。這其中既有制度性不完善的問題，也有管理和執(zhí)行的問題。

　　目前，以部門預(yù)算、國庫集中收付和政府采購等三項制度改革為標志的預(yù)算會計管理改革，有利于實現(xiàn)財政預(yù)算管理的科學(xué)化、法制化和規(guī)范化，也是從源頭上治理腐敗，提高財政資金使用效益的重大舉措，它標志著我國公共預(yù)算建設(shè)進入了一個新的歷史時期，但這些政策涉及面廣、政策性強，改革中必然會遇到許多新問題、新情況。

　　第一，政府會計制度不完善。我國現(xiàn)行預(yù)算會計制度中，除事業(yè)單位經(jīng)營性收支業(yè)務(wù)核算可采用權(quán)責(zé)發(fā)生制外，總預(yù)算會計與行政單位會計都實行收付實現(xiàn)制。財政支出只包括以現(xiàn)金實際支付的部分，不反映哪些當期雖已發(fā)生，但尚未用現(xiàn)金支付的部分，最典型的是拖欠征地補償款和農(nóng)民工工資。此外，會計報告內(nèi)容不完整，反映信息過于簡單。我國行政事業(yè)單位的國有固定資產(chǎn)沒有匯總反映成為總預(yù)算會計報表信息，因而為將資產(chǎn)處置游離于財政監(jiān)督之外的財務(wù)處理創(chuàng)造機會。

　　第二，政府財力有限。這幾年中央和地方財政收入連續(xù)高速增長，但從目前我國財政資金供求狀況看，各部門、單位事業(yè)發(fā)展的資金需求與財政資金相對不足的矛盾依然突出，這是部門上報建議數(shù)與財政最終批復(fù)數(shù)懸殊過大的重要原因，也是不嚴格執(zhí)行預(yù)算、擠占挪用專項資金等違規(guī)問題的重要原因。

　　第三，部門利益驅(qū)動。部門預(yù)算是零基預(yù)算，預(yù)算單位往往過多考慮自身利益，不考慮國家財力負擔(dān)情況，編制過于理想化的部門預(yù)算，將預(yù)測到的各項支出全部列足，甚至編制尚未立項、無依據(jù)、不必要的項目預(yù)算，加大了預(yù)算資金總量，使預(yù)算建議數(shù)大大超過控制限額。在編制收入預(yù)算時又想方設(shè)法隱瞞自行組織的財力，最大限度地爭取財政撥款。

　　第四，財政撥款時間的限制。預(yù)算外資金的申請、撥付手續(xù)繁瑣，時效性差，會影響部門、單位的用款計劃。財政追加預(yù)算撥款多集中在年底，由于撥款較晚，當年根本無法開展或?qū)嵤╉椖�，造成單位虛列支出掛賬，或者以撥列支，結(jié)轉(zhuǎn)隱瞞。財政追加的預(yù)算，除政策性、突發(fā)性因素外，許多追加專項經(jīng)費帶有明顯經(jīng)費補助性質(zhì)，資金使用帶有一定的隨意性，客觀上使一些單位擠占挪用財政資金。

　　第五，單位屬性、關(guān)系不明。有些部門所屬單位性質(zhì)模糊，非企非事，事企不分，人、財、物、職能與主管部門界限不清，這些單位的人員工資、水、電、暖等費用仍由財政負擔(dān)，而其財務(wù)收支又游離于預(yù)算之外，導(dǎo)致預(yù)、決算收支不實，成為滋生腐敗的溫床。

　　第六，政府采購工作不到位。一方面，有些部門、單位過多考慮花錢方便，對政府采購、國庫集中支付態(tài)度不積極；另一方面，目前政府采購在時效性、規(guī)范性、效益性和服務(wù)質(zhì)量等方面存在不足，影響了采購單位對政府采購的積極性。

　　對于預(yù)算管理中存在的種種問題，應(yīng)該采取一些措施從制度上予以完善。

　　第一，從國際經(jīng)驗來看，政府財務(wù)報告是一種全面、系統(tǒng)地反映政府財務(wù)狀況的核算方式，也是披露政府會計綜合信息的一種規(guī)范化途徑。而我國現(xiàn)有的政府預(yù)、決算還不能滿足各方使用者的需要，建立更加全面、與國際接軌的政府財務(wù)報告制度，是政府預(yù)算會計制度改革的一個基本方向。正在進行的部門預(yù)算和國庫制度的改革，是我國逐漸引進新的會計制度的一個基礎(chǔ)。一段時期內(nèi)，我國可逐步實施滾動預(yù)算方法，對各部門的預(yù)算使用情況和資產(chǎn)占用情況進行績效評價，并可將部分預(yù)算收支項目試行權(quán)責(zé)發(fā)生制，為權(quán)責(zé)發(fā)生制預(yù)算創(chuàng)造條件。

　　第二，基本支出和項目支出是預(yù)算支出的重點內(nèi)容，為做好這兩項預(yù)算，中央及地方各級財政部門都制定了基本支出預(yù)算管理、項目支出預(yù)算管理、預(yù)算單位清產(chǎn)核資等配套辦法，財政部門應(yīng)根據(jù)這些辦法的規(guī)定，制定明確的定額標準，嚴格審查項目，摸清部門家底，為編好部門預(yù)算提供科學(xué)真實的參考依據(jù)。

　　第三，從預(yù)算角度看，預(yù)算外資金收入和支出已納入部門預(yù)算并經(jīng)人大批準，無需再履行繁瑣的申請手續(xù)，應(yīng)按預(yù)算及時、足額撥付。追加預(yù)算要控制規(guī)模，嚴格審批，維護預(yù)算的嚴肅性。撥款要有計劃，避免年底突擊追加預(yù)算和撥款。

　　第四，深化事業(yè)單位改革，明確單位性質(zhì)和財政管理體制。要通過事業(yè)單位改革，明確單位性質(zhì)和財政供養(yǎng)范圍，避免出現(xiàn)財政供給“越位”。行政辦實體、事業(yè)辦實體及部分協(xié)會等單位，要實現(xiàn)人、財、物、職能的徹底分離，理順財政管理體制，減輕財政負擔(dān)，避免財政資金浪費和國有資產(chǎn)流失。