1、允許抵扣固定資產(chǎn)進(jìn)項(xiàng)稅額。修訂前的增值稅條例規(guī)定，購進(jìn)固定資產(chǎn)的進(jìn)項(xiàng)稅額不得從銷項(xiàng)稅額中抵扣，即實(shí)行生產(chǎn)型增值稅，這樣企業(yè)購進(jìn)機(jī)器設(shè)備稅負(fù)比較重。為減輕企業(yè)負(fù)擔(dān)，修訂后的增值稅條例刪除了有關(guān)不得抵扣購進(jìn)固定資產(chǎn)的進(jìn)項(xiàng)稅額的規(guī)定，允許納稅人抵扣購進(jìn)固定資產(chǎn)的進(jìn)項(xiàng)稅額，實(shí)現(xiàn)增值稅由生產(chǎn)型向消費(fèi)型的轉(zhuǎn)換。
2、房屋、建筑物等不動(dòng)產(chǎn)仍不納入增值稅的抵扣范圍�，F(xiàn)行增值稅征稅范圍中的固定資產(chǎn)主要是機(jī)器、機(jī)械、運(yùn)輸工具以及其他與生產(chǎn)、經(jīng)營有關(guān)的設(shè)備、工具、器具，因此，轉(zhuǎn)型改革后允許抵扣的固定資產(chǎn)仍然是上述范圍。房屋、建筑物等不動(dòng)產(chǎn)不能納入增值稅的抵扣范圍。
3、明確可以抵扣固定資產(chǎn)的范圍。一是明確除專門用于非應(yīng)稅項(xiàng)目、免稅項(xiàng)目等的機(jī)器設(shè)備進(jìn)項(xiàng)稅額不得抵扣外，包括混用的機(jī)器設(shè)備在內(nèi)的其他機(jī)器設(shè)備進(jìn)項(xiàng)稅額均可抵扣；二是明確不動(dòng)產(chǎn)在建工程不允許抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額，并對(duì)其概念進(jìn)行了界定；三是與企業(yè)技術(shù)更新無關(guān)且容易混為個(gè)人消費(fèi)的自用消費(fèi)品所含的進(jìn)項(xiàng)稅額，不得予以抵扣，具體明確為應(yīng)征消費(fèi)稅的游艇、汽車和摩托車。
4、相應(yīng)取消進(jìn)口設(shè)備免稅政策和外商投資企業(yè)購買國產(chǎn)設(shè)備增值稅退稅政策。
5、降低小規(guī)模納稅人的征收率。修訂前的增值稅條例規(guī)定，小規(guī)模納稅人的征收率為6%。根據(jù)條例的規(guī)定，經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，從1998年起已經(jīng)將小規(guī)模納稅人劃分為工業(yè)和商業(yè)兩類，征收率分別為6%和4%�？紤]到增值稅轉(zhuǎn)型改革后，一般納稅人的增值稅負(fù)擔(dān)水平總體降低，為了平衡小規(guī)模納稅人與一般納稅人之間的稅負(fù)水平，促進(jìn)中小企業(yè)的發(fā)展和擴(kuò)大就業(yè)，應(yīng)當(dāng)降低小規(guī)模納稅人的征收率。同時(shí)考慮到現(xiàn)實(shí)經(jīng)濟(jì)活動(dòng)中，小規(guī)模納稅人混業(yè)經(jīng)營十分普遍，實(shí)際征管中難以明確劃分工業(yè)和商業(yè)小規(guī)模納稅人，因此修訂后的增值稅條例對(duì)小規(guī)模納稅人不再設(shè)置工業(yè)和商業(yè)兩檔征收率，將征收率統(tǒng)一降至3%。
6、將一些現(xiàn)行增值稅政策體現(xiàn)到修訂后的條例中。主要是補(bǔ)充了有關(guān)農(nóng)產(chǎn)品和運(yùn)輸費(fèi)用扣除率、對(duì)增值稅一般納稅人進(jìn)行資格認(rèn)定等規(guī)定，取消了已不再執(zhí)行的對(duì)來料加工、來料裝配和補(bǔ)償貿(mào)易所需進(jìn)口設(shè)備的免稅規(guī)定。如：
細(xì)則第十七條：條例第八條第二款第（三）項(xiàng)所稱買價(jià)，包括納稅人購進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品在農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票或者銷售發(fā)票上注明的價(jià)款和按規(guī)定繳納的煙葉稅。
細(xì)則第十八條： 條例第八條第二款第（四）項(xiàng)所稱運(yùn)輸費(fèi)用金額，是指運(yùn)輸費(fèi)用結(jié)算單據(jù)上注明的運(yùn)輸費(fèi)用（包括鐵路臨管線及鐵路專線運(yùn)輸費(fèi)用）、建設(shè)基金，不包括裝卸費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)等其他雜費(fèi)。
7、將金屬礦和非金屬礦采選產(chǎn)品的增值稅率從13％恢復(fù)到17％。主要原因：一是對(duì)不可再生的礦產(chǎn)資源適用低稅率，不符合資源節(jié)約、環(huán)境保護(hù)的要求；二是減少了資源開采地的稅收收入，削弱資源開采地提供公共產(chǎn)品的能力；三是礦產(chǎn)資源基本都作為原料使用，礦山企業(yè)少交的增值稅因下個(gè)環(huán)節(jié)減少進(jìn)項(xiàng)稅額而補(bǔ)征回來，政策效果并不明顯；四是導(dǎo)致征納雙方要對(duì)這類適用低稅率的貨物與其他貨物劃分，增大征收和納稅成本。
8、增值稅小規(guī)模納稅人標(biāo)準(zhǔn)和相關(guān)規(guī)定的調(diào)整主要包括兩方面：一是將現(xiàn)行工業(yè)和商業(yè)小規(guī)模納稅人銷售額標(biāo)準(zhǔn)分別從100萬元和180萬元降為50萬元和80萬元；二是將現(xiàn)行年應(yīng)稅銷售額超過小規(guī)模納稅人標(biāo)準(zhǔn)的個(gè)人、非企業(yè)性單位、不經(jīng)常發(fā)生應(yīng)稅行為的企業(yè)統(tǒng)一按小規(guī)模納稅人納稅的規(guī)定，調(diào)整為年應(yīng)稅銷售額超過小規(guī)模納稅人標(biāo)準(zhǔn)的其他個(gè)人（自然人）繼續(xù)按小規(guī)模納稅人納稅，而非企業(yè)性單位和不經(jīng)常發(fā)生應(yīng)稅行為的企業(yè)可以自行選擇是否按小規(guī)模納稅人納稅。
9、繼續(xù)維持對(duì)混合銷售行為處理的一般原則，即按照納稅人的主營業(yè)務(wù)統(tǒng)一征收增值稅或者營業(yè)稅。但鑒于銷售自產(chǎn)貨物并同時(shí)提供建筑業(yè)勞務(wù)的混合銷售行為較為特殊，對(duì)其采用分別核算、分別征收增值稅和營業(yè)稅的辦法。
10、根據(jù)稅收征管實(shí)踐，為了方便納稅人納稅申報(bào)，提高納稅服務(wù)水平，緩解征收大廳的申報(bào)壓力，將納稅申報(bào)期限從10日延長至15日。明確了對(duì)境外納稅人如何確定扣繳義務(wù)人、扣繳義務(wù)發(fā)生時(shí)間、扣繳地點(diǎn)和扣繳期限的規(guī)定。