上市公司股權(quán)分置改革，是通過非流通股股東和流通股股東之間的利益平衡協(xié)商機制，消除A股市場股份轉(zhuǎn)讓制度性差異的過程。
目前，我國上市公司股權(quán)分置改革基本已經(jīng)完成。綜觀整個股權(quán)分置改革，補償流通股的形式主要分為兩類：
1、非權(quán)證形式的補償：包括：
�。�1）非流通股股東直接支付現(xiàn)金給流通股股東；
（2）送股給流通股股東（如10送4），使流通股股東的持股比例將上升，非流通股股東不送股，持股比例將下降；非流通股股東縮股（如按照1：0.65的比例單向縮股），將使非流通股持股比例下降，流通股股東持股比例上升；
（3）將上市公司資本公積金轉(zhuǎn)增或派發(fā)股票股利形成的股份中非流通股股東分得的部分，送給流通股東，使流通股股東持股比例上升；
�。�4）非流通股股東向上市公司注入優(yōu)質(zhì)資產(chǎn)、豁免上市公司債務(wù)、替上市公司承擔債務(wù)，將使上市公司價值增加，使流通股股東的權(quán)益增加；
（5）承諾。
2、權(quán)證形式的補償：包括非流通股股東向流通股股東發(fā)放認購權(quán)證和認沽權(quán)證，在特定時期內(nèi)行使該權(quán)利，使流通股股東獲益。
而《國家稅務(wù)總局關(guān)于股權(quán)分置改革中上市公司取得資產(chǎn)及債務(wù)豁免對價收入征免所得稅問題的批復(fù)》（國稅函[2009]375）號文主要針對的就是股權(quán)分置改革中非權(quán)證形式補償中的第四類， 非流通股股東向上市公司注入優(yōu)質(zhì)資產(chǎn)、豁免上市公司債務(wù)、替上市公司承擔債務(wù)，使上市公司價值增加，從而導(dǎo)致流通股股東的權(quán)益增加。
對于在股權(quán)分置改革中這種形式的對價補償，實際上涉及到的是三方稅務(wù)處理的問題：
1、非流通股股東：對于非流通股股東注入優(yōu)質(zhì)資產(chǎn)、豁免上市公司債務(wù)、替上市公司承擔債務(wù)，非流通股股東應(yīng)做如何的稅務(wù)處理；
2、流通股股東：由于非流通股股東采取上述方式增加的上市公司價值，流通股股東權(quán)益增加了是否要進行相應(yīng)的稅務(wù)處理
3、上市公司：上市公司取得非流通股股東注入優(yōu)質(zhì)資產(chǎn)、豁免債務(wù)或替為承擔債務(wù)稅務(wù)上應(yīng)如何處理。
對于股權(quán)分置改革的會計處理問題，財政部專門下發(fā)了《上市公司股權(quán)分置改革相關(guān)會計處理暫行規(guī)定》（財會[2005]18號），下面，我們將就具體案例，結(jié)合會計處理來講講股權(quán)分置改革涉及的這三方的稅務(wù)處理問題；
案例：A上市公司進行股權(quán)分置改革。假設(shè)證監(jiān)會的相關(guān)規(guī)定，公司達成了如下三種股權(quán)分置改革方案：
方案1：非流通股股東豁免上市公司欠該股東的1000萬的債務(wù)
根據(jù)《上市公司股權(quán)分置改革相關(guān)會計處理暫行規(guī)定》（財會[2005]18號）：非流通股股東應(yīng)做如下會計處理：
借：股權(quán)分置流通權(quán) 1000萬
貸：應(yīng)收賬款 1000萬
由于上市公司增加了1000萬的資本公積，非流通股股東也需要進行相應(yīng)的會計處理。如果該非流通股股東持股比例超過50%，對上市公司形成控制的，其對持有的上市公司股權(quán)按成本法核算，則無需進行會計處理。如果其持有上市公司股權(quán)只有30%，不構(gòu)成控制，只是重大影響的，其對上市公司股份按權(quán)益法核算，則應(yīng)同時做如下會計處理：
借：長期股權(quán)投資——其他權(quán)益變動 300萬（1000×30%）
貸：資本公積——其他資本公積 300萬
上市公司應(yīng)做如下會計處理：
借：應(yīng)付賬款 1000萬
貸：資本公積——其他資本公積 1000萬
對于流通股股東，其持有的上市公司的流通股一般應(yīng)作為交易性金融資產(chǎn)或可供出售金融資產(chǎn)進行會計核算。對于這兩類金融資產(chǎn)的會計處理，在非流通股股東通過向上市公司注入優(yōu)質(zhì)資產(chǎn)或豁免債務(wù)環(huán)節(jié)，流通股股東是不需要進行會計處理的。他們只需要在資產(chǎn)負債表日根據(jù)這兩類金融資產(chǎn)的公允價值分別進行會計處理。如果是交易性金融資產(chǎn)，公允價值變動計入當期損益。而可供出售金融資產(chǎn)的公允價值變動則計入資本公積——其他資本公積。
稅務(wù)處理：
非流通股股東豁免上市公司債務(wù)，不能直接確認壞賬損失在企業(yè)所得稅前扣除。而是作為取得非流通股的流通權(quán)支付的對價，在流通股轉(zhuǎn)讓時扣除。比如，該非流通股股東持有上市公司1000萬股非流通股，初始的計稅成本為3元/股。在進行股權(quán)分置改革后，非流通股股東豁免了上市公司1000萬元債務(wù)，這就相當于每股非流通股增加1元成本。假設(shè)該非流通股股東轉(zhuǎn)讓了300萬股，每股10元，則稅收上應(yīng)確認的轉(zhuǎn)讓收益=300×10-300×3-300/1000×1000=1800（萬元）。
上市公司取得的債務(wù)豁免，根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于股權(quán)分置改革中上市公司取得資產(chǎn)及債務(wù)豁免對價收入征免所得稅問題的批復(fù)》（國稅函[2009]375）的規(guī)定：股權(quán)分置改革中，上市公司因股權(quán)分置改革而接受的非流通股股東作為對價注入資產(chǎn)和被非流通股股東豁免債務(wù)，上市公司應(yīng)增加注冊資本或資本公積，不征收企業(yè)所得稅。這個已經(jīng)是非常明確的了。
對于流通股股東，在該方式下，非流通股股東是通過豁免上市公司債務(wù)，提高上市公司價值變相提高流通股股東持股權(quán)益的，此時流通股股東并為獲得任何直接的對價支付。因此，國稅函[2009]375中提到的，《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于股權(quán)分置試點改革有關(guān)稅收政策問題的通知》（財稅[2005]103號）中關(guān)于“股權(quán)分置改革中非流通股股東通過對價方式向流通股股東支付的股份、現(xiàn)金等收入，暫免征收流通股股東應(yīng)繳納的企業(yè)所得稅和個人所得稅”對這種股權(quán)分置改革方案是不適用的。流通股股東此時不需要進行任何稅務(wù)處理，其持有流通股股權(quán)的暗含增值收益將在轉(zhuǎn)讓時一并體現(xiàn)，如果是企業(yè)股東，轉(zhuǎn)讓時收益繳納企業(yè)所得稅。個人股東通過證券市場轉(zhuǎn)讓股票收益暫免征收個人所得稅。
方案2：非流通股股東替上市公司承擔1000萬債務(wù)
這種方式下，三方的會計和稅務(wù)處理和第一種方式基本一致。只不過是在非流通股股東的會計處理中，將貸方貸的應(yīng)收賬款換為應(yīng)付賬款而已。這里，就不詳細解說了。
方案3：非流通股股東將其持有的其全資房地產(chǎn)公司的100%的股權(quán)注入上市公司作為股改對價。該長期股權(quán)投資注入前的賬面價值為1000萬元，計稅成本和賬面價值相同，公允價值2000萬。
非流通股股東的會計處理
根據(jù)《上市公司股權(quán)分置改革相關(guān)會計處理暫行規(guī)定》規(guī)定：企業(yè)根據(jù)經(jīng)過批準的股權(quán)分置方案，向上市公司注入優(yōu)質(zhì)資產(chǎn)、豁免上市公司債務(wù)、替上市公司承擔債務(wù)的，應(yīng)按照注入資產(chǎn)、豁免債務(wù)、承擔債務(wù)的賬面價值，借記“股權(quán)分置流通權(quán)”科目，貸記相關(guān)資產(chǎn)或負債科目。
借：股權(quán)分置流通權(quán) 1000萬
貸：長期股權(quán)投資——某子公司 1000萬
同樣，非流通股股東如果持股比例超過50%，按成本法核算，則無需進行進一步會計處理。如果是按權(quán)益法核算長期股權(quán)投資的，假設(shè)持股比例為30%，則應(yīng)做如下會計處理：
借：長期股權(quán)投資——其他權(quán)益變動 600萬（2000×30%）
貸：資本公積——其他資本公積 600萬
上市公司會計處理：
對于上市公司取得的非流通股股東注入的資產(chǎn)，應(yīng)按公允價值入賬：
借：長期股權(quán)投資 2000萬
貸：資本公積——其他資本公積 2000萬
流通股股東的會計處理方法同方案1，這里就不再詳細解說了。
稅務(wù)處理：
非流通股股東：
對于非流通股股東用其持有的全資子公司100%的股權(quán)作為對價支付給上市公司，根據(jù)《企業(yè)所得稅法實施條例》第二十五條的規(guī)定，應(yīng)做視同銷售處理。因此，該非流通股股東在股權(quán)辦理過戶時，應(yīng)按1000萬（2000-1000）繳納企業(yè)所得稅。此時，會計上確認的股權(quán)分置流通權(quán)的成本為1000萬，而稅收上股權(quán)分置流通權(quán)的計稅成本為2000萬。
上市公司：
上市公司取得的注入資產(chǎn)，根據(jù)國家稅務(wù)總局關(guān)于股權(quán)分置改革中上市公司取得資產(chǎn)及債務(wù)豁免對價收入征免所得稅問題的批復(fù)》（國稅函[2009]375）的規(guī)定，增加資本公積，不征收企業(yè)所得稅。
流通股股東的稅務(wù)處理同方案1，這里也不再敘述了。