財政補助收入是指事業(yè)單位按核定的預算和經(jīng)費領報關系從財政部門取得的各類事業(yè)經(jīng)費。
財政補助收入和財政的支付方式有關系。總體上我國實行國庫集中收付制度，有兩種支付方式：財政直接支付；財政授權支付。對于沒有實行國庫集中收付制度的單位，采用傳統(tǒng)的支付方式：財政實撥資金。
1.財政直接支付
一般是大額的、重要的、經(jīng)常性的支出，比如工資支出、工程采購支出、物品和服務采購支出等。財政直接支付是財政部門直接將款項支付給收款單位，不支付給事業(yè)單位。預算單位應于收到財政國庫支付執(zhí)行機構委托代理銀行轉(zhuǎn)來的“財政直接支付入賬通知書”時，按入賬通知書中標明的金額確認收入。
賬務處理：
財政直接支付方式下，支付時直接借記有關支出，貸記“財政補助收入”科目。
對于由財政直接支付的工資，事業(yè)單位的會計處理是，借記“事業(yè)支出”科目，貸記“財政補助收入”科目。
對于由財政直接支付的購買材料、服務的款項，事業(yè)單位的會計處理是，借記“材料”等科目，貸記“財政補助收入”科目。
對于由財政直接支付的購置固定資產(chǎn)的款項，事業(yè)單位的會計處理是，借記“事業(yè)支出”科目，貸記“財政補助收入”科目；同時，借記“固定資產(chǎn)”科目，貸記“固定基金”科目。
2.財政授權支付
此種方式下有個待結算賬戶：零余額賬戶用款額度。財政授權支付程序適用于未納入財政直接支付的財政性資金和零星支出。事業(yè)單位應于收到零余額賬戶代理銀行蓋章的“授權支付到賬通知書”時，按到賬通知書標明的額度確認收入。
賬務處理：
①收到“授權支付到賬通知書”后，借記“零余額賬戶用款額度”（過渡性的待結算賬戶，相當于企業(yè)的銀行存款）科目，貸記 “財政補助收入”科目。
�、谑聵I(yè)單位購買物品、服務等支用額度時，借記“經(jīng)費支出”或“事業(yè)支出”、“材料”等科目，貸記“零余額賬戶用款額度”科目；
�、蹖τ谫徣牍潭ㄙY產(chǎn)的，借“事業(yè)支出”，貸“零余額賬戶用款額度”，同時，還應借記“固定資產(chǎn)”科目，貸記“固定基金”科目；
�、苁聵I(yè)單位從零余額賬戶提取現(xiàn)金時，借記“現(xiàn)金”科目，貸記“零余額賬戶用款額度”科目。
3.財政實撥資金
財政部門在審核后，將資金直接撥入事業(yè)單位的開戶銀行。
賬務處理：
事業(yè)單位按收款通知書所列金額，借記“銀行存款”等科目，貸記“財政補助收入”科目。
【例】2009年10月9日，某事業(yè)單位根據(jù)經(jīng)過批準的部門預算和用款計劃，向主管財政申請支付第三季度水費110 000元。10月18日，財政部門經(jīng)審核后，采用財政直接支付方式為其向自來水公司支付了105 000元。10月23日，該事業(yè)單位收到了財政零余額賬戶代理銀行轉(zhuǎn)來的財政支付到賬通知書。該事業(yè)單位應于10月23日進行賬務處理如下：
借：事業(yè)支出 105 000
貸：財政補助收入 105 000
【例】2009年3月7日，某科研所根據(jù)經(jīng)過批準的部門預算和用款計劃，為開展某項科學研究項目，向主管財政申請財政授權支付用款額度180 000元。4月6日，財政部門經(jīng)審核后，采用財政授權支付方式下達了170 000元用款額度。4月8日，該科研所收到了財政零余額賬戶代理銀行轉(zhuǎn)來的財政授權支付到賬通知書。該科研所應于4月8日，進行賬務處理如下：
借：零余額賬戶用款額度 170 000
貸：財政補助收入 170 000
在財政補助收入總賬科目的貸方，作明細登記如下：
項目支出——科學技術——基礎研究——專項基礎研究
【例】某事業(yè)單位尚未實行國庫集中收付制度。2009年6月7日，該單位收到開戶銀行轉(zhuǎn)來的收款通知，收到財政部門撥入的日常事業(yè)活動經(jīng)費25 000元。6月7日，該事業(yè)單位應進行賬務處理如下：
借：銀行存款 25 000
貸：財政補助收入 25 000