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可以計算抵扣。根據(jù)《中華人民共和國增值稅暫行條例》第六十條的規(guī)定，購買某個企業(yè)經(jīng)營的農產品的，可以使用普通免稅發(fā)票計算抵扣，但需要經(jīng)過增值稅有關部門的審核，經(jīng)過審核后才可以進行抵扣。拓展知識:抵扣前提，必須保證購買所得發(fā)票合法，這就要求企業(yè)應當留存按照規(guī)定填寫的增值稅普通發(fā)票，以便以后有關部門進行審核核實。