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一般來說，企業(yè)收到基金會（民非組織）資助進行農(nóng)業(yè)研究的款項后，應(yīng)該開具發(fā)票作為入賬憑證。 具體來說，如果企業(yè)是接受捐贈的受贈方，根據(jù)《中華人民共和國公益事業(yè)捐贈法》的規(guī)定，受贈方應(yīng)當在接受捐贈后，向捐贈方出具合法、有效的收據(jù)或者發(fā)票，并加蓋財務(wù)印章和法定代表人印章。如果企業(yè)是提供服務(wù)的提供方，根據(jù)《中華人民共和國合同法》的規(guī)定，提供方應(yīng)當向受服務(wù)方提供發(fā)票或者收據(jù)等合法有效的憑證，作為受服務(wù)方入賬的依據(jù)。 因此，如果企業(yè)是提供服務(wù)的提供方，應(yīng)當向基金會（民非組織）提供發(fā)票或者收據(jù)等合法有效的憑證；如果企業(yè)是接受捐贈的受贈方，應(yīng)當向基金會（民非組織）出具合法、有效的收據(jù)或者發(fā)票，并加蓋財務(wù)印章和法定代表人印章。同時，企業(yè)應(yīng)當按照《中華人民共和國會計法》等法律法規(guī)的規(guī)定，建立規(guī)范的會計賬簿和財務(wù)報表，確保資金使用的合法性和規(guī)范性。