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（一）所得稅 目前我國針對新能源發(fā)電企業(yè)的所得稅，在計算過程中都是從該新能源企業(yè)第一批產品獲得收入之后的納稅年度開始進行，在前三年會免征新能源企業(yè)的所得稅，第四年到第六年企業(yè)所得稅只需要繳納一半。但是目前很多新能源發(fā)電企業(yè)對于所得稅優(yōu)惠政策的認知力度不足，在享受該稅務優(yōu)惠政策過程中沒有進行優(yōu)惠政策的落實，還有著以下幾點問題：首先我國很多新能源企業(yè)對于享受優(yōu)惠政策開始的時間在認知上有一定的問題，認為其是從第一筆開具發(fā)票的時間開始的。但是我國稅收政策中，將該企業(yè)電力設備開始投入使用后獲得第一筆收入作為首次享受優(yōu)惠稅收政策的時間。對于發(fā)電企業(yè)而言，其在獲取經濟效益跟開具發(fā)票還有著一定的時間差，也就導致了企業(yè)在享受三免三減半優(yōu)惠政策過程中存在有一定的問題。此外很多新能源發(fā)電企業(yè)將非項目生產經營所得稅經營所得享受優(yōu)惠政策，但是在我國稅收政策中，要求企業(yè)對不在目錄范圍內的經營效益跟享受優(yōu)惠政策的公共基礎設施項目的經濟效益進行分開核算，如果是單獨核算的項目，不得享受該稅收優(yōu)惠政策，一些非項目經營所得的效益，也不享受該優(yōu)惠稅收政策，具體包含有財政貸款貼息以及固定資產收益等等。此外項目經營所得與非項目經營所得互相彌補虧損。因此各新能源發(fā)電企業(yè)不得允許應稅項目跟減免稅項目所得以及虧損相互彌補等問題出現，值得說明的是關于應稅所得與免稅虧損是否可以相互彌補，各個區(qū)域的稅務局也沒有進行明確定論，因此企業(yè)在實際納稅過程中需要先對當地的稅務機關進行咨詢，后續(xù)方能夠進行。 （二）增值稅 在我國財稅81號文件中，明確了風力、太陽能發(fā)電所產生的電力實現增值稅，需要實行即征即退的50%政策。但是很多企業(yè)在享受上述優(yōu)惠政策過程中，還存在有以下幾點涉稅風險。我國很多企業(yè)對于即征即退收入以及一般貨物收入中的增值稅并沒有嚴格進行劃分，增值稅的優(yōu)惠政策只有新能源發(fā)電企業(yè)的清潔能源的生產效益才能夠享受，其他收入實現的增值稅要作為一般貨物收入計算。但是我國很多企業(yè)還沒明確增值稅退稅收，所得稅延期繳納問題頻頻發(fā)生，增值稅在入庫之后也無法及時進行返還。在實務中因為退稅流程復雜以及當地政策緊張等因素，導致了在增值稅退還過程中存在有時間比較長以及跨年現象頻頻發(fā)生等問題出現。