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在總公司與分公司位于同一地方，且總公司負(fù)責(zé)進(jìn)行企業(yè)所得稅匯繳清算的情況下，如果匯繳清算結(jié)果顯示總公司與分公司各自承擔(dān)一半的稅費，即總共產(chǎn)生稅額2000元，總公司已經(jīng)扣款1000元，而分公司不能直接進(jìn)行匯繳清算，那么剩余的1000元稅費可以通過以下方式處理： 1.內(nèi)部轉(zhuǎn)賬：總公司可以通過內(nèi)部轉(zhuǎn)賬的方式，將分公司應(yīng)承擔(dān)的1000元稅費支付給稅務(wù)部門。這需要總公司與分公司之間進(jìn)行協(xié)調(diào)，確保分公司將這1000元轉(zhuǎn)賬給總公司。 2.分公司預(yù)提稅費：分公司在其財務(wù)報表中預(yù)提這1000元稅費，作為對總公司的應(yīng)付款項。然后，在適當(dāng)?shù)臅r機(jī)，分公司將這筆款項支付給總公司，由總公司統(tǒng)一繳納給稅務(wù)部門。 3.稅務(wù)部門協(xié)調(diào)：如果分公司確實無法直接進(jìn)行匯繳清算，也可以與稅務(wù)部門進(jìn)行溝通，說明情況并請求協(xié)助。稅務(wù)部門可能會根據(jù)實際情況，提供相應(yīng)的解決方案或指導(dǎo)。 請注意，具體的處理方式可能因地區(qū)、稅法規(guī)定以及公司實際情況而有所不同。因此，在處理此類問題時，建議咨詢專業(yè)的稅務(wù)顧問或會計師，以確保合規(guī)性和準(zhǔn)確性。