我國各級各類獨立核算的公立醫(yī)療機構(gòu)（簡稱醫(yī)院）財務(wù)管理工作必須遵循的行政法規(guī)。醫(yī)院財務(wù)制度于1998年財政部、衛(wèi)生部頒發(fā)，共分14章82條。
第一章總則，明確本制度的適用范圍，確定醫(yī)院是政府實行一定福利政策、非營利的社會公益事業(yè)，對醫(yī)院財務(wù)管理的基本任務(wù)、管理原則、總會計師制度、領(lǐng)導(dǎo)關(guān)系以及醫(yī)療和藥品收支的核算管理原則等作了規(guī)定。
第二章預(yù)算管理，明確醫(yī)院的預(yù)算編制原則、預(yù)算的編制程序。預(yù)算編制內(nèi)容規(guī)定為收入預(yù)算、支出預(yù)算、投資收益、專項基金預(yù)算。
第三章基金管理，明確醫(yī)院基金的概念和分類，對各類基金的管理辦法作了規(guī)定。
第四章負(fù)債管理，明確醫(yī)院負(fù)債的概念和內(nèi)容，對負(fù)債管理辦法作了規(guī)定。
第六章固定資產(chǎn)管理，明確醫(yī)院固定資產(chǎn)的概念和分類。對固定資產(chǎn)的計價、折舊制度和辦法、修理費用、盤盈盤虧及毀損、實物管理等方面作了規(guī)定。
第七章無形資產(chǎn)和遞延資產(chǎn)管理，明確醫(yī)院無形資產(chǎn)和遞延資產(chǎn)的概念和內(nèi)容，并對管理辦法作了規(guī)定。
第八章對外投資管理，明確醫(yī)院對外投資的概念和內(nèi)容，并對管理辦法作規(guī)定。醫(yī)院附設(shè)的非醫(yī)療性服務(wù)單位執(zhí)行有關(guān)行業(yè)的會計制度。
第九章收入管理，確定醫(yī)院收入的內(nèi)容。對醫(yī)院收費管理、收入憑證管理、門診和住院收費處管理等項制度作了規(guī)定。
第十章支出管理，明確醫(yī)院支出的概念和內(nèi)容，分別對醫(yī)療支出、藥品支出、管理費用和其他支出的分類管理作了規(guī)定。
第十一章結(jié)余及其分配，明確醫(yī)院結(jié)余的概念、內(nèi)容及其計算方法，對結(jié)余分配的辦法作了規(guī)定。
第十二章財務(wù)結(jié)算，明確醫(yī)院結(jié)算的含義、內(nèi)容、組織工作程序和清償順序，對結(jié)算工作作了有關(guān)的規(guī)定。
第十三章財務(wù)報告與評價，明確財務(wù)報告的概念、財務(wù)報告體系的內(nèi)容以及報告的時限、年度決算的要求。對財務(wù)監(jiān)督和檢查作了規(guī)定。確定財務(wù)分析評價的內(nèi)容、指標(biāo)和方法。
第十四章附則，明確醫(yī)院取得行醫(yī)資格的財務(wù)登記、醫(yī)院基本建設(shè)投資的財務(wù)管理、醫(yī)院實施本制度的清產(chǎn)核資等規(guī)定。指出本制度自1998年×月×日起執(zhí)行，過去與本制度相抵觸的有關(guān)規(guī)定同時廢止。各省、自治區(qū)、直轄市及計劃單位列市財政部門和主管可制定具體實施辦法。
