近年來我國非營利組織發(fā)展迅速，在消除貧困、發(fā)展教育、保護(hù)環(huán)境等方面發(fā)揮了重要作用，成為建設(shè)社會(huì)主義和諧社會(huì)不可缺少的力量，為了進(jìn)一步規(guī)范非營利組織的納稅秩序，財(cái)政部、國家稅務(wù)總局發(fā)布了《關(guān)于非營利組織企業(yè)所得稅免稅收入問題的通知》財(cái)稅[2009]122號(hào)（以下簡稱“財(cái)稅[2009]122號(hào)”）和《關(guān)于非營利組織免稅資格認(rèn)定管理有關(guān)問題的通知》財(cái)稅[2009]123號(hào)（以下簡稱“財(cái)稅[2009]123號(hào)”）。
非營利組織的概念
非營利組織指那些不以營利為目的、不分配收益、活動(dòng)有公益性或互助互益性，主要從事、慈善、科學(xué)、教育、文化、衛(wèi)生、扶貧和法律援助等事業(yè)和活動(dòng)的組織。其組織形式主要有三類：社團(tuán)、民辦非企業(yè)單位和基金會(huì)。根據(jù)上述非營利組織的定義，非營利組織有如下五個(gè)方面的特點(diǎn)：非營利性；非政府性：公益眭或互助互益性；獨(dú)立性；志愿性。
明確五項(xiàng)免稅范圍
企業(yè)所得稅法實(shí)旋條例第八十五條規(guī)定：符合條件的非營利組織的收入，不包括非營利組織從事營利性活動(dòng)取得的收入，但國務(wù)院財(cái)政、稅務(wù)主管部門另有規(guī)定的除外。根據(jù)上述規(guī)定，非營利組織取得的以下兩類收入不免稅：
1.不符合條件的非營利組織取得的收入不免稅：
2.非營利組織從事營利性活動(dòng)取得的收入不免稅。
根據(jù)財(cái)稅[2009]122號(hào)，非營利組織的下列收入為免稅收入：
1.接受其他單位或者個(gè)人捐贈(zèng)的收入：
2.除《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第七條規(guī)定的財(cái)政撥款以外的其他政府補(bǔ)助收入，但不包括因政府購買服務(wù)取得的收入：
3.按照省級(jí)以上民政、財(cái)政部門規(guī)定收取的會(huì)費(fèi)；
4.不征稅收入和免稅收入孳生的銀行存款利息收入：
5.財(cái)政部、國家稅務(wù)總局規(guī)定的其他收入。
即使非營利組織符合免稅條件，也不一定其所有的收入都能夠免稅，能夠免稅的只限于非營利組織從事非營利性活動(dòng)取得的收入。我國的非營利組織一般不能從事營利性活動(dòng)，為規(guī)范此類組織的活動(dòng)，防止從事營利性活動(dòng)可能帶來的稅收漏洞，對非營利組織的營利性活動(dòng)取得的收入，不予免稅。
申請方可免稅
經(jīng)省級(jí)（含省級(jí)）以上登記管理機(jī)關(guān)批準(zhǔn)設(shè)立或登記的非營利組織，凡符合規(guī)定條件的，應(yīng)向其所在地省級(jí)稅務(wù)主管機(jī)關(guān)提出免稅資格申請，并提供本通知規(guī)定的相關(guān)材料；經(jīng)市（地）級(jí)或縣級(jí)登記管理機(jī)關(guān)批準(zhǔn)設(shè)立或登記的非營利組織，凡符合規(guī)定條件的，分別向其所在地市（地）級(jí)或縣級(jí)稅務(wù)主管機(jī)關(guān)提出免稅資格申請，并提供本通知規(guī)定的相關(guān)材料。申請享受免稅資格的非營利組織，需報(bào)送以下材料：
1.申請報(bào)告：
2.事業(yè)單位、社會(huì)團(tuán)體、基金會(huì)、民辦非企業(yè)單位的組織章程或宗教活動(dòng)場所的管理制度；
3.稅務(wù)登記證復(fù)印件；
4.非營利組織登記證復(fù)印件：
5.申請前年度的資金來源及使用情況、公益活動(dòng)和非營利活動(dòng)的明細(xì)情況：
6.具有資質(zhì)的中介機(jī)構(gòu)鑒證的申請前會(huì)計(jì)年度的財(cái)務(wù)報(bào)表和審計(jì)報(bào)告：
7.登記管理機(jī)關(guān)出具的事業(yè)單位、社會(huì)團(tuán)體、基金會(huì)、民辦非企業(yè)單位申請前年度的年度檢查結(jié)論；
8.財(cái)政、稅務(wù)部門要求提供的其他材料。
有效期限和執(zhí)行時(shí)間
非營利組織免稅優(yōu)惠資格的有效期為五年。非營利組織應(yīng)在期滿前三個(gè)月內(nèi)提出復(fù)審申請，不提出復(fù)審申請或復(fù)審不合格的，其享受免稅優(yōu)惠的資格到期自動(dòng)失效。
兩文件都是從2008年1月1日起執(zhí)行，在該文公布前發(fā)生的業(yè)務(wù)可參照相關(guān)條文納稅調(diào)整。
按期進(jìn)行納稅申報(bào)
非營利組織必須按照《中華人民共和國稅收征收管理法》及《中華人民共和國稅收征收管理法實(shí)施細(xì)則》等有關(guān)規(guī)定，辦理稅務(wù)登記，按期進(jìn)行納稅申報(bào)。取得免稅資格的非營利組織應(yīng)按照規(guī)定向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理免稅手續(xù)，免稅條件發(fā)生變化的，應(yīng)當(dāng)自發(fā)生變化之日起十五日內(nèi)向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報(bào)告；不再符合免稅條件的，應(yīng)當(dāng)依法履行納稅義務(wù)；未依法納稅的，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)予以追繳。取得免稅資格的非營利組織注銷時(shí)，剩余財(cái)產(chǎn)處置違反本通知第一條第五項(xiàng)規(guī)定的，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)追繳其應(yīng)納企業(yè)所得稅款。