最近，公司總部和跨省的分公司之間企業(yè)所得稅方面問題較多，現在小編做一個簡單的掃盲。
依據《跨地區(qū)經營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》（國家稅務總局公告2012年第57號）的規(guī)定，居民企業(yè)在中國境內跨地區(qū)（指跨省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市）設立不具有法人資格分支機構的，該居民企業(yè)為跨地區(qū)經營匯總納稅企業(yè)，簡稱匯總納稅企業(yè)。
匯總納稅企業(yè)有何規(guī)定
匯總納稅企業(yè)實行“統(tǒng)一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算、財政調庫”的企業(yè)所得稅征收管理辦法：
�。ㄒ唬┙y(tǒng)一計算，是指總機構統(tǒng)一計算包括匯總納稅企業(yè)所屬各個不具有法人資格分支機構在內的全部應納稅所得額、應納稅額。
�。ǘ┓旨壒芾恚侵缚倷C構、分支機構所在地的主管稅務機關都有對當地機構進行企業(yè)所得稅管理的責任，總機構和分支機構應分別接受機構所在地主管稅務機關的管理。
（三）就地預繳，是指總機構、分支機構應按本辦法的規(guī)定，分月或分季分別向所在地主管稅務機關申報預繳企業(yè)所得稅。
�。ㄋ模﹨R總清算，是指在年度終了后，總機構統(tǒng)一計算匯總納稅企業(yè)的年度應納稅所得額、應納所得稅額，抵減總機構、分支機構當年已就地分期預繳的企業(yè)所得稅款后，多退少補。
�。ㄎ澹┴斦{庫，是指財政部定期將繳入中央國庫的匯總納稅企業(yè)所得稅待分配收入，按照核定的系數調整至地方國庫。
總機構和具有主體生產經營職能的二級分支機構，就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
二級分支機構，是指匯總納稅企業(yè)依法設立并領取非法人營業(yè)執(zhí)照（登記證書），且總機構對其財務、業(yè)務、人員等直接進行統(tǒng)一核算和管理的分支機構。
以下二級分支機構不就地分攤繳納企業(yè)所得稅：
（一）不具有主體生產經營職能，且在當地不繳納增值稅、營業(yè)稅的產品售后服務、內部研發(fā)、倉儲等匯總納稅企業(yè)內部輔助性的二級分支機構，不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
�。ǘ┥夏甓日J定為小型微利企業(yè)的，其二級分支機構不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
�。ㄈ┬略O立的二級分支機構，設立當年不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
�。ㄋ模┊斈瓿蜂N的二級分支機構，自辦理注銷稅務登記之日所屬企業(yè)所得稅預繳期間起，不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
�。ㄎ澹﹨R總納稅企業(yè)在中國境外設立的不具有法人資格的二級分支機構，不就地分攤繳納企業(yè)所得稅。
總分機構分攤稅款的計算
總機構按以下公式計算分攤稅款：
總機構分攤稅款=匯總納稅企業(yè)當期應納所得稅額×50％
分支機構按以下公式計算分攤稅款：
所有分支機構分攤稅款總額=匯總納稅企業(yè)當期應納所得稅額×50％
某分支機構分攤稅款=所有分支機構分攤稅款總額×該分支機構分攤比例
總機構和分支機構企業(yè)所得稅稅率不一致，計算分攤比例
總機構和分支機構處于不同稅率地區(qū)的，先由總機構統(tǒng)一計算全部應納稅所得額，然后按規(guī)定的比例和計算的分攤比例，計算劃分不同稅率地區(qū)機構的應納稅所得額，再分別按各自的適用稅率計算應納稅額后加總計算出匯總納稅企業(yè)的應納所得稅總額，最后按規(guī)定的比例和計算的分攤比例，向總機構和分支機構分攤就地繳納的企業(yè)所得稅款。
規(guī)定的比例：匯總納稅企業(yè)按照《企業(yè)所得稅法》規(guī)定匯總計算的企業(yè)所得稅，包括預繳稅款和匯算清繳應繳應退稅款，50%在各分支機構間分攤，各分支機構根據分攤稅款就地辦理繳庫或退庫；50%由總機構分攤繳納，其中25%就地辦理繳庫或退庫，25%就地全額繳入中央國庫或退庫。
計算的分攤比例：總機構應按照上年度分支機構的營業(yè)收入、職工薪酬和資產總額三個因素計算各分支機構分攤所得稅款的比例；三級及以下分支機構，其營業(yè)收入、職工薪酬和資產總額統(tǒng)一計入二級分支機構；三因素的權重依次為0.35、0.35、0.30.
計算公式如下：某分支機構分攤比例=（該分支機構營業(yè)收入／各分支機構營業(yè)收入之和）×0.35+（該分支機構職工薪酬／各分支機構職工薪酬之和）×0.35+（該分支機構資產總額／各分支機構資產總額之和）×0.30.
那么分支機構經營虧損，還需要分配企業(yè)所得稅嗎？
依據《跨地區(qū)經營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》（國家稅務總局公告2012年第57號）的規(guī)定，分公司如果是虧損仍需要匯總后按規(guī)定重新分配稅款。如果分公司虧損，但企業(yè)匯總之后需要繳稅的，分公司仍需按總機構分配的稅額繳稅。
辦理匯算清繳手續(xù)的規(guī)定
匯總納稅企業(yè)應當自年度終了之日起5個月內，由總機構匯總計算企業(yè)年度應納所得稅額，扣除總機構和各分支機構已預繳的稅款，計算出應繳應退稅款，按照本辦法規(guī)定的稅款分攤方法計算總機構和分支機構的企業(yè)所得稅應繳應退稅款，分別由總機構和分支機構就地辦理稅款繳庫或退庫。
匯總納稅企業(yè)在納稅年度內預繳企業(yè)所得稅稅款少于全年應繳企業(yè)所得稅稅款的，應在匯算清繳期內由總、分機構分別結清應繳的企業(yè)所得稅稅款；預繳稅款超過應繳稅款的，主管稅務機關應及時按有關規(guī)定分別辦理退稅，或者經總、分機構同意后分別抵繳其下一年度應繳企業(yè)所得稅稅款。
