A公司是廈門的一家生物醫(yī)藥公司，2015年在廣州設立了一家分公司B公司。

這兩天，A公司的財務小林在年度企業(yè)所得稅申報過程中遇到了不少問題，帶著困惑的他特地到稅務局進行咨詢，如果您也是跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)，在進行年度企業(yè)所得稅申報時也有不少困惑，那就快看看下面這些問答吧~

一、作為分公司的B公司需要匯算清繳嗎？

根據(jù)《國家稅務總局關于印發(fā)的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號），跨地區(qū)經(jīng)營的二級分支機構需要匯算清繳，作為分公司的B公司需要年度申報，但如果總分機構AB公司都在廈門的，目前廈門的執(zhí)行方式是：統(tǒng)一由總機構匯總納稅，分支機構不需要年度申報。

二、A公司和B公司如何計算各自的應納稅額？

根據(jù)《國家稅務總局關于印發(fā)的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號），由作為總公司的A公司匯總計算企業(yè)年度應納所得稅額，扣除總機構A和分支機構B已預繳的稅款，計算出應繳應退稅款，A公司繳納應納所得稅額的50%部分，剩余的50%由各分支機構分攤（本案例中只有一個分公司B，因此剩余的50%則由B公司全部承擔）。

三、作為分公司的B公司想享受研發(fā)加計扣除的稅收優(yōu)惠，那應該找分公司的主管稅務機關廣州國稅備案，還是找總公司的主管稅務機關廈門國稅備案呢？

根據(jù)《國家稅務總局關于發(fā)布《企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策事項辦理辦法》的公告》(國家稅務總局公告2015年第76號)規(guī)定：“第十四條 跨地區(qū)(省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)(以下簡稱匯總納稅企業(yè))的優(yōu)惠事項，按以下情況辦理：

①：如果分支機構享受所得減免、研發(fā)費用加計扣除、安置殘疾人員、促進就業(yè)、部分區(qū)域性稅收優(yōu)惠(西部大開發(fā)、經(jīng)濟特區(qū)、上海浦東新區(qū)、深圳前海、廣東橫琴、福建平潭)，以及購置環(huán)境保護、節(jié)能節(jié)水、安全生產(chǎn)等專用設備投資抵免稅額優(yōu)惠，由二級分支機構向其主管稅務機關備案。其他優(yōu)惠事項由總機構統(tǒng)一備案。

②：總機構應當匯總所屬二級分支機構已備案優(yōu)惠事項，填寫《匯總納稅企業(yè)分支機構已備案優(yōu)惠事項清單》，隨同企業(yè)所得稅年度納稅申報表一并報送其主管稅務機關。

因此，B公司的研發(fā)費用加計扣除的備案應該找分公司的主管稅務機關廣州國稅辦理。A公司應匯總B公司備案的優(yōu)惠事項，填寫《匯總納稅企業(yè)分支機構已備案優(yōu)惠事項清單》，隨同企業(yè)所得稅年度納稅申報表一并報送其主管稅務機關廈門國稅。

四、作為分公司的B公司2016年度因為臺風發(fā)生了資產(chǎn)損失，應如何申報？

根據(jù)《國家稅務總局關于印發(fā)的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號），第二十五條 匯總納稅企業(yè)發(fā)生的資產(chǎn)損失，應按以下規(guī)定申報扣除：

①：總機構及二級分支機構發(fā)生的資產(chǎn)損失，除應按專項申報和清單申報的有關規(guī)定各自向所在地主管稅務機關申報外，二級分支機構還應同時上報總機構;三級及以下分支機構發(fā)生的資產(chǎn)損失不需向所在地主管稅務機關申報，應并入二級分支機構，由二級分支機構統(tǒng)一申報。

②：總機構對各分支機構上報的資產(chǎn)損失，除稅務機關另有規(guī)定外，應以清單申報的形式向所在地主管稅務機關申報。

③：總機構將分支機構所屬資產(chǎn)捆綁打包轉讓所發(fā)生的資產(chǎn)損失，由總機構向所在地主管稅務機關專項申報。

臺風的資產(chǎn)損失屬于專項申報。分公司B應向廣州國稅做資產(chǎn)損失專項申報，同時向總公司A報告，總公司A應以清單申報的形式向廈門國稅申報。

五、A公司和B公司在辦理年度匯算清繳時，應報送哪些資料？

根據(jù)《國家稅務總局關于印發(fā)的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號）和 《國家稅務總局關于印發(fā)的通知》（國稅發(fā)〔2009〕79號）的要求：

匯總納稅企業(yè)匯算清繳時，總機構除報送企業(yè)所得稅年度納稅申報表和年度財務報表、備案事項相關資料外，還應報送總機構及分支機構基本情況、分支機構征稅方式、分支機構的預繳稅情況、匯總納稅企業(yè)分支機構所得稅分配表、分支機構的年度財務報表和分支機構參與企業(yè)年度納稅調(diào)整情況的說明。若總公司委托中介機構代理納稅申報的，還應出具雙方簽訂的代理合同，并附送中介機構出具的包括納稅調(diào)整的項目、原因、依據(jù)、計算過程、調(diào)整金額等內(nèi)容的報告。若涉及關聯(lián)方業(yè)務往來的，同時報送《中華人民共和國企業(yè)年度關聯(lián)業(yè)務往來報告表》。

分支機構除報送企業(yè)所得稅年度納稅申報表(只填列部分項目)外，還應報送經(jīng)總機構所在地主管稅務機關受理的匯總納稅企業(yè)分支機構所得稅分配表、分支機構的年度財務報表(或年度財務狀況和營業(yè)收支情況)和分支機構參與企業(yè)年度納稅調(diào)整情況的說明。

若發(fā)生資產(chǎn)損失、優(yōu)惠備案等情況，還需依上述問題解答提供資料作為附送資料。

撰稿：海滄區(qū)國稅局