商業(yè)企業(yè)經營的農業(yè)特產品，主要有煙葉產品、茶葉產品、水產品、牲畜產品、園藝產品、林木產品等，其采購成本包括支付的收購價款、稅金等。
稅金是指企業(yè)在收購免稅農業(yè)特產品時，由收購者代扣代繳的生產環(huán)節(jié)應納的農業(yè)特產稅和在收購環(huán)節(jié)應由收購者繳納的農業(yè)特產稅兩部分，即企業(yè)向農民收購某些農業(yè)特產品時，要按收購金額和法定稅率繳納農業(yè)特產稅。該種稅金本應由生產者繳納，但為了集中稅源和便于征收，現(xiàn)行稅法規(guī)定由收購單位代扣代繳。對企業(yè)來說，農業(yè)特產品收購環(huán)節(jié)所繳納的農業(yè)特產稅和代生產者繳納的農業(yè)特產稅，作為農業(yè)特產品進價的組成部分，計入農業(yè)特產品的進價成本，但應扣除農業(yè)特產品收購價加農業(yè)特產稅之和按抵扣率10%計算的增值稅。
根據(jù)增值稅原理，納稅人購進免稅貨物不能予以抵扣，這是國際上通行的做法。但各國都將購進免稅農業(yè)特產品作為特例處理。這是因為：
一方面，對農民征收增值稅是一個很困難的問題，大多數(shù)國家對農民都不征收增值稅；
另一方面，農民本身雖不納稅，但農產品的投入物都是征收的，所以，農產品價格中含有增值稅。如果購進免稅農產品的價格中所含增值稅不予抵扣，農產品的流通和以農產品為原料的輕紡產品的生產，必然存在重復征稅因素。
因此，大多數(shù)國家在對農產品免稅的同時，都允許扣除購進農產品價格中所含有的稅金。根據(jù)有關資料測算，目前我國農業(yè)生產投入物成本約占農產品價格的70%，按原有14%的增值稅稅率計算，農產品價格中所含的比例約9.8%。因此，按整數(shù)10%作為購進農產品的抵扣率較為適宜（我國現(xiàn)行規(guī)定就按此比例）。
企業(yè)收購農業(yè)特產品，按實際支付的價款，借記“物資采購”，貸記“銀行存款”或“現(xiàn)金”；計算收購的應稅農業(yè)特產稅之和與按10%的扣除率計算的抵扣稅額，借記“應交稅金——應交增值稅（進項稅額）”；按收購價款和應交農業(yè)特產稅之和減去抵扣稅額，借記“庫存商品”，貸記“物資采購”。
［例］某經營農業(yè)特產品收購的商業(yè)企業(yè)，由采購員到某地收購水果，收購價格50000元。作會計分錄如下：
支付收購價款時：
借：物資采購 50000
貸：現(xiàn)金 50000
繳納農業(yè)特產稅時：
設水果的農業(yè)特產稅率為12%。
代扣應納農業(yè)特產稅＝50000／（1－12%）×12%＝56818×12%＝6818（元）。
借：物資采購 6818
貸：應交稅金——應交農業(yè)特產稅 6818
驗收入庫時：
計算應扣除的增值稅＝（50000＋6818）×10%＝5682（元）
水果不含增值稅成本＝50000＋6818－5682＝51136（元）
借：庫存商品——水果 51136
應交稅金——應交增值稅（進項稅額） 5682
貸：物資采購 56818